簡(jiǎn)介
作為噬菌體衍生的酶,內溶素本質(zhì)是一種蛋白分子,其通過(guò)分解細菌細胞壁的肽聚糖成分,幫助噬菌體顆粒從細菌宿主釋放,可在噬菌體復制過(guò)程中表達,破壞細菌細胞壁肽聚糖的關(guān)鍵化學(xué)鍵。
原理
通過(guò)內溶素的蛋白表達、純化能夠將內溶素基因克隆到表達載體(如 pET28a),進(jìn)一步轉化大腸桿菌進(jìn)行擴增,重組質(zhì)粒經(jīng) IPTG 誘導表達,得到經(jīng)鎳柱純化的內溶素蛋白。
用途
為治療抗生素耐藥的細菌感染提供潛在解決方案。
材料與儀器
儀器:
離心機、超聲破碎儀
恒溫搖床、恒溫培養箱、PCR 儀、電泳儀
凝膠掃描儀、鎳柱純化系統、0.22 μm 濾膜
試劑:
質(zhì)粒提取試劑盒、膠回收試劑盒
核酸內切酶、T4 連接酶、Pfu 聚合酶
IPTG、考馬斯亮藍
步驟
1、引物設計:對待研究的內溶素完成基因組測序注釋工作,根據已測基因組進(jìn)行引物設計 P1 與 P2,并引入酶切位點(diǎn)。
2、PCR 擴增內溶素基因:反應體系與程序見(jiàn)表 1。
3、PCR 反應條件:95 ℃ 預變性 5 min,95 ℃ 變性 30 s,Tm 溫度下退火30 s,72 ℃ 延伸 30 s,共 30 個(gè)循環(huán),72 ℃ 最后延伸 10 min,26 ℃ 再反應 2 min(終止反應)。
4、回收 PCR 產(chǎn)物膠:進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳,將 50 μL 全部上樣,切下目的基因條帶,使用膠回收試劑盒回收目的基因(一般實(shí)驗室都會(huì )有常用品牌)。
5、抽提質(zhì)粒:使用質(zhì)粒抽提試劑盒抽提載體質(zhì)粒(一般實(shí)驗室都會(huì )有常用品牌)。
6、對位點(diǎn)進(jìn)行酶切:利用一開(kāi)始設計好的酶切位點(diǎn)對載體與目的基因進(jìn)行雙酶切,在 37 ℃ 下反應 3 h。
7、切膠回收:將酶切產(chǎn)物進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳,切取含 DNA 片段的目的條帶并進(jìn)行回收,得到 DNA 后檢測其濃度并保存在 -20 ℃ 冰箱備用。
8、DNA 與載體連接:用 T4 連接酶連接載體與 DNA 片段,在 16 ℃ 下過(guò)夜。
9、轉化大腸桿菌:取 50 μL 大腸桿菌 BL21 感受態(tài)細胞,加入 5 μL 連接液后冰上孵育 30 min,搖勻后 42 ℃ 水浴熱休克 90 s,然后迅速冰浴 2 min,冰浴后再加入已經(jīng)預熱的 1 mL LB 培養基,37 ℃ 搖床震蕩 1 h 復蘇,最后涂板至卡那霉素抗性的平板,37 ℃ 溫度下培養過(guò)夜。次日挑取單菌落進(jìn)行菌落 PCR,將陽(yáng)性菌落接種于培養基中 37 ℃ 溫度下培養過(guò)夜。
10、抽提質(zhì)粒并進(jìn)行雙酶切驗證(參見(jiàn) 5、6 步)。
1、少量誘導表達:挑選單菌落過(guò)夜培養,過(guò)夜菌接種至 1 mL 培養基,37 ℃ 培養 2~3 h,再加入 10 μL 0.1 M 的 IPTG 在 16 ℃ 誘導 4 h,取 20 μL 菌液加入 7.5 μL 的蛋白緩沖上樣液,100 ℃ 沸水煮 10 min 后電泳,倒入考馬斯亮藍過(guò)夜震蕩,清洗后尋找發(fā)現目標蛋白條帶存在,進(jìn)一步擴大培養。
2、擴大培養:將陽(yáng)性菌落涂布平板過(guò)夜,挑選單菌落接種至 10 mL 培養基,37 ℃ 培養 6 h,按 1:100 比例接種于 500 mL 培養液中,37 ℃ 搖床至 OD600 值為 0.6~0.8,加入終濃度為 1 mM 的 IPTG 誘導劑,在 16 ℃ 下繼續培養 12 h。
3、細胞破碎:菌液離心 10 min(4000 g,4 ℃),重懸于 30 mL PBS,加入 PMSF 和 tritonX-100 冰浴 1 h 后超聲破碎,破碎菌液在 4 ℃ 轉入 50 mL 離心管,12000 rpm 離心10 min,取上清液用 0.22 μm 濾膜過(guò)濾雜質(zhì)。
4、蛋白純化:采用 Ni-NTA 純化系統進(jìn)行鎳柱親和層析純化目的蛋白,純化后跑電泳,分析蛋白純度。
注意事項
1. PCR 條件與程序需要根據實(shí)驗進(jìn)行梯度摸索。
2. T4 連接酶在高溫不穩定,通常 16 ℃ 連接過(guò)夜,在 25 ℃ 左右的室溫能維持七八個(gè)小時(shí)。
常見(jiàn)問(wèn)題
蛋白誘導表達效果不好(蛋白誘導表達條件并不一定適用所有實(shí)驗室,需要自己做實(shí)驗摸索條件)。
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