細胞STR分型介紹
細胞STR分型(cell line STR genotyping)也稱(chēng)為短串聯(lián)重復序列(short tandem repeat,STR)分型、簡(jiǎn)單重復序列(SSR)分型或微衛星標記(Microsatellite)分型,是檢測廣泛分布在真核生物基因組中的簡(jiǎn)單重復序列。一般由2-6bp的核心序列串聯(lián)重復而成,構成了STR基因座的遺傳多態(tài)性。對于一個(gè)特定的個(gè)體,染色體上某個(gè)特定位置的重復序列的重復次數是固定的,而對于不同的個(gè)體重復次數可能不同,這就構成了人群中STR的多態(tài)性。由于人類(lèi)基因組中這種重復序列非常多,通過(guò)對STR多態(tài)性的檢測,就可以區分個(gè)體之間的差異,確定親緣關(guān)系。
STR/SSR具有分布廣泛均勻、多態(tài)性豐富、遵循孟德?tīng)柟诧@性遺傳、信息量大、檢測簡(jiǎn)便等優(yōu)點(diǎn),STR/SSR分型快捷,結果準確,是非常重要的遺傳標記,在遺傳制圖、連鎖性分析、親子鑒定、疾病基因定位和物種多態(tài)性研究等領(lǐng)域有著(zhù)廣泛的應用。
微衛星位點(diǎn)通常通過(guò)PCR擴增,擴增產(chǎn)物通過(guò)電泳分析檢測。ABI3730XL遺傳分析儀對熒光標記DNA Fragments進(jìn)行檢測,加上分子量?jì)葮诉M(jìn)行DNA Fragments長(cháng)度計算,使STR分型變得快捷,結果也更加可靠,可以實(shí)現包括單倍型分析、遺傳連鎖分析或構建遺傳連鎖圖譜等在內的多種應用。
檢測內容
編號 | 服務(wù)名稱(chēng) | 內容說(shuō)明 | 周 期 |
MG301 | 微衛星 單色檢測 | 單色檢測,數據分析size等 | 5工作日 |
MG302 | 微衛星 多單色檢測 | 多色檢測,數據分析size等 | 5工作日 |
MG303 | 微衛星 AFLP跑板 | 上機檢測,數據分析01矩陣等 | 5工作日 |
MG304 | 微衛星 STR跑板 | 上機檢測,不分析數據等 | 5工作日 |
MG305 | 微衛星 普通引物合成 | 20D,PAGE純化,不超過(guò)30堿基 | 5工作日 |
MG306 | 微衛星 熒光引物合成 | FAM 2OD HEX 20D TMR 2OD ROX 2OD | 7工作日 |
MG307 | 微衛星 引物設計 | 不含驗證 | 3工作日 |
技術(shù)優(yōu)勢
1. 開(kāi)發(fā)SSR多態(tài)性引物
針對基因組序列信息未知或不完整的物種,開(kāi)發(fā)出多態(tài)性比較好的SSR引物。
1) 序列已知:根據數據庫發(fā)布的全基因組序列或EST序列,得到微衛星序列信息。
2) 序列未知:采用磁珠富集的方法,對微衛星序列進(jìn)行富集、克隆、測序,得到微衛星序列信息。
2. 大量群體樣本微衛星分析
針對已開(kāi)發(fā)出的多態(tài)性SSR位點(diǎn),對大量群體樣本進(jìn)行微衛星分析,得到個(gè)體的基因型。
3. 根據個(gè)體的基因型進(jìn)行連鎖分析
1) 遺傳連鎖圖譜。
2) 連鎖不平衡分析。
3) LOH分析。
檢測結果示例
我們的優(yōu)勢
1、提供各種實(shí)驗材料和儀器,滿(mǎn)足項目課題實(shí)驗需要。
2、專(zhuān)業(yè)的操作人員。
3、高規格實(shí)驗室。
4、數據結果交付周期快。
5、完善的服務(wù)體系,全程跟進(jìn),確保滿(mǎn)意。
服務(wù)流程
1、提交項目課題相關(guān)需求和資料。
2、與我們的專(zhuān)業(yè)技術(shù)團隊討論項目細節。
3、根據討論后的意見(jiàn)對實(shí)驗方案進(jìn)行修改。
4、雙方均滿(mǎn)意并達成一致,簽訂技術(shù)服務(wù)合同。
5、開(kāi)展實(shí)驗,按期完成合同規定的內容。
6、結題,提供實(shí)驗原始結果和分析結果、實(shí)驗流程、實(shí)驗條件等等。
咨詢(xún)與訂購
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