Takara是一家總部位于日本京都的生物醫藥企業(yè),起源于1841年,正式創(chuàng )立于1925年。該公司主要從事研究試劑、科學(xué)儀器、保健食品以及基因和細胞治療產(chǎn)品(CDMO)的研發(fā)和銷(xiāo)售。
對于生命科學(xué)工作者來(lái)說(shuō),Takara應該不陌生,其提供的限制性?xún)惹忻负途酆厦甘菍?shí)驗室中常用試劑。Takara也是世界上shou批提供生命科學(xué)科研用試劑以及商用PCR儀器和試劑的企業(yè)。
TaKaRa逆轉錄試劑盒是一種將RNA逆轉錄為cDNA的專(zhuān)用試劑。RNA的純度可以影響cDNA的合成量,而制備RNA的關(guān)鍵就是要抑制細胞中的RNA裂解酶,并防止所用儀器和試劑中RNA裂解酶的污染。因此,在實(shí)驗中必須采取以下措施:戴一次性干凈手套;使用RNA操作專(zhuān)用實(shí)驗臺;在操作過(guò)程中避免講話(huà)等等。通過(guò)以上辦法可以防止實(shí)驗者的汗液、唾液中的RNA分解酶的污染。制品中附加了標準曲線(xiàn)制作用稀釋液EASY Dilution(for Real Time PCR)將Total RNA或cDNA稀釋至低濃度時(shí)也能夠進(jìn)行準確稀釋?zhuān)菀自趯拸V范圍內獲得準確定量的標準曲線(xiàn)。
提取的Total RNA中常?;煊谢蚪MDNA,而基因組DNA可以直接作為PCR模板進(jìn)行擴增,造成解析結果不準確。為了避免這種情況發(fā)生,我們必須采取如下兩種措施:1、引物設計時(shí)避免基因組DNA擴增;2、使用DNase I處理除去基因組DNA。
1、引物設計時(shí)避免基因組DNA擴增
我們可以利用基因組DNA具有外顯子和內含子的結構,在引物設計上下工夫,使PCR反應時(shí)不能擴增基因組DNA。此時(shí)我們首先應確認目的基因的基因組結構,選擇較長(cháng)的內含子。然后,在這個(gè)內含子兩側的外顯子上分別設計上、下游引物。Real Time PCR反應時(shí)通常擴增的目的DNA片段長(cháng)度都比較短設置的條件也是適合短片段DNA的擴增,超過(guò)500bp就很難擴增了。所以,當內含子足夠長(cháng)時(shí),基因組DNA來(lái)源的擴增就不能發(fā)生:當內含子較短時(shí),基因組DNA來(lái)源的擴增可能發(fā)生,但基因組DNA來(lái)源的擴增產(chǎn)物比mRNA來(lái)源的擴增產(chǎn)物長(cháng),可通過(guò)分析融解曲線(xiàn)的方法加以區分。但是,此種方法不適合具有單個(gè)外顯子的基因、或者不具有內含子的生物種以及基因組情報沒(méi)被解析的生物種等,此時(shí)必須采取方法2解決。
2、使用DNase I處理除去基因組DNA
使用常規方法提取Total RNA后,再使用DNase I分解混入的基因組DNA,最后進(jìn)行苯酚/氯仿抽提乙醇沉淀等純化Total RNA。
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